Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTR2AP28223 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR2AP28223 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms