Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARK3P27448 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARK3P27448 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARK3P27448 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARK3P27448 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARK3P27448 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK3P27448 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK3P27448 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK3P27448 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK3P27448 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK3P27448 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK3P27448 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK3P27448 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK3P27448 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK3P27448 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK3P27448 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARK3P27448 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARK3P27448 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARK3P27448 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK3P27448 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK3P27448 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK3P27448 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK3P27448 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK3P27448 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK3P27448 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK3P27448 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK3P27448 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK3P27448 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK3P27448 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK3P27448 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK3P27448 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARK3P27448 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms