Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms