Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PTPRGP23470 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRGP23470 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
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