Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB3P21860 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms