Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms