Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCP20941 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCP20941 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCP20941 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCP20941 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCP20941 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCP20941 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCP20941 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCP20941 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCP20941 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCP20941 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCP20941 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCP20941 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCP20941 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCP20941 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCP20941 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCP20941 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCP20941 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCP20941 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCP20941 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCP20941 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCP20941 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCP20941 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCP20941 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCP20941 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCP20941 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCP20941 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCP20941 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCP20941 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCP20941 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCP20941 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCP20941 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCP20941 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCP20941 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCP20941 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCP20941 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCP20941 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCP20941 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCP20941 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCP20941 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCP20941 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCP20941 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCP20941 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCP20941 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCP20941 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCP20941 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCP20941 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCP20941 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCP20941 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCP20941 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCP20941 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCP20941 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCP20941 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCP20941 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCP20941 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCP20941 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCP20941 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCP20941 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCP20941 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCP20941 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCP20941 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCP20941 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCP20941 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCP20941 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCP20941 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCP20941 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCP20941 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCP20941 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCP20941 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCP20941 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCP20941 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms