Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASA1P20936 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASA1P20936 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASA1P20936 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASA1P20936 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RASA1P20936 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASA1P20936 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RASA1P20936 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA1P20936 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA1P20936 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA1P20936 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA1P20936 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA1P20936 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA1P20936 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA1P20936 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA1P20936 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASA1P20936 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA1P20936 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA1P20936 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA1P20936 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA1P20936 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA1P20936 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA1P20936 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA1P20936 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA1P20936 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA1P20936 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA1P20936 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA1P20936 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA1P20936 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RASA1P20936 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASA1P20936 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASA1P20936 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASA1P20936 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASA1P20936 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASA1P20936 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASA1P20936 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASA1P20936 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASA1P20936 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASA1P20936 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASA1P20936 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASA1P20936 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASA1P20936 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RASA1P20936 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASA1P20936 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASA1P20936 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASA1P20936 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASA1P20936 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASA1P20936 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASA1P20936 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASA1P20936 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASA1P20936 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASA1P20936 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASA1P20936 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASA1P20936 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASA1P20936 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RASA1P20936 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASA1P20936 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASA1P20936 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms