Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PVALBP20472 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PVALBP20472 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PVALBP20472 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PVALBP20472 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PVALBP20472 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PVALBP20472 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PVALBP20472 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PVALBP20472 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PVALBP20472 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PVALBP20472 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PVALBP20472 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PVALBP20472 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PVALBP20472 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PVALBP20472 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PVALBP20472 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PVALBP20472 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PVALBP20472 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PVALBP20472 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PVALBP20472 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PVALBP20472 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PVALBP20472 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms