Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC3P19447 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms