Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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