Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LBPP18428 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LBPP18428 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LBPP18428 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LBPP18428 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LBPP18428 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LBPP18428 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LBPP18428 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LBPP18428 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms