Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN1P18031 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms