Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms