Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB4P16144 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms