Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARGP13631 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARGP13631 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RARGP13631 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARGP13631 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARGP13631 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARGP13631 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARGP13631 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARGP13631 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RARGP13631 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARGP13631 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARGP13631 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARGP13631 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARGP13631 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARGP13631 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARGP13631 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARGP13631 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARGP13631 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARGP13631 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARGP13631 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARGP13631 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARGP13631 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARGP13631 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARGP13631 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARGP13631 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARGP13631 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARGP13631 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARGP13631 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARGP13631 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARGP13631 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARGP13631 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARGP13631 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARGP13631 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RARGP13631 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARGP13631 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARGP13631 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARGP13631 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms