Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms