Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC37■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC37■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC37■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC37■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOP2AP11388 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC36.95■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms