Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GLI2P10070 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GLI2P10070 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GLI2P10070 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GLI2P10070 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GLI2P10070 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
GLI2P10070 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GLI2P10070 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GLI2P10070 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GLI2P10070 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GLI2P10070 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI2P10070 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI2P10070 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI2P10070 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI2P10070 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI2P10070 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI2P10070 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI2P10070 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GLI2P10070 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GLI2P10070 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GLI2P10070 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GLI2P10070 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GLI2P10070 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
GLI2P10070 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GLI2P10070 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GLI2P10070 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GLI2P10070 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GLI2P10070 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
GLI2P10070 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GLI2P10070 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GLI2P10070 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI2P10070 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GLI2P10070 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GLI2P10070 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
GLI2P10070 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GLI2P10070 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GLI2P10070 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GLI2P10070 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GLI2P10070 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GLI2P10070 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GLI2P10070 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GLI2P10070 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GLI2P10070 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GLI2P10070 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GLI2P10070 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GLI2P10070 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GLI2P10070 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GLI2P10070 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms