Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RD3LP0DJH9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms