Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms