Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NGFRP08138 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NGFRP08138 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NGFRP08138 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NGFRP08138 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NGFRP08138 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NGFRP08138 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NGFRP08138 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NGFRP08138 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NGFRP08138 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NGFRP08138 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NGFRP08138 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NGFRP08138 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NGFRP08138 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NGFRP08138 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NGFRP08138 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NGFRP08138 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NGFRP08138 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NGFRP08138 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NGFRP08138 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NGFRP08138 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NGFRP08138 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NGFRP08138 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NGFRP08138 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NGFRP08138 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NGFRP08138 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NGFRP08138 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NGFRP08138 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NGFRP08138 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NGFRP08138 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NGFRP08138 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NGFRP08138 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NGFRP08138 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NGFRP08138 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NGFRP08138 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NGFRP08138 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms