Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM2P07951 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM2P07951 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM2P07951 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM2P07951 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM2P07951 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM2P07951 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM2P07951 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM2P07951 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM2P07951 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM2P07951 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPM2P07951 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM2P07951 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM2P07951 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM2P07951 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM2P07951 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM2P07951 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM2P07951 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM2P07951 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM2P07951 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM2P07951 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM2P07951 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM2P07951 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPM2P07951 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM2P07951 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM2P07951 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM2P07951 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM2P07951 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM2P07951 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM2P07951 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM2P07951 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM2P07951 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM2P07951 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPM2P07951 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPM2P07951 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPM2P07951 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPM2P07951 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms