Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP1A1P05023 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A1P05023 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms