Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN1P04843 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN1P04843 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN1P04843 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN1P04843 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN1P04843 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN1P04843 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN1P04843 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN1P04843 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN1P04843 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN1P04843 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN1P04843 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN1P04843 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN1P04843 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN1P04843 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN1P04843 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN1P04843 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN1P04843 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN1P04843 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN1P04843 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN1P04843 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN1P04843 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN1P04843 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN1P04843 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN1P04843 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN1P04843 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN1P04843 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN1P04843 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPN1P04843 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPN1P04843 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms