Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOA1P02647 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOA1P02647 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOA1P02647 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOA1P02647 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOA1P02647 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOA1P02647 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOA1P02647 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOA1P02647 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOA1P02647 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOA1P02647 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOA1P02647 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA1P02647 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA1P02647 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA1P02647 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA1P02647 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA1P02647 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA1P02647 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA1P02647 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA1P02647 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA1P02647 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA1P02647 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOA1P02647 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOA1P02647 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOA1P02647 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms