Protein–RNA interactions for Protein: P00352

ALDH1A1, Retinal dehydrogenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A1P00352 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A1P00352 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALDH1A1P00352 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALDH1A1P00352 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALDH1A1P00352 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A1P00352 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A1P00352 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A1P00352 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A1P00352 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms