Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX7O95931 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX7O95931 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX7O95931 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX7O95931 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CBX7O95931 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX7O95931 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CBX7O95931 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms