Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms