Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD1O95696 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD1O95696 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD1O95696 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD1O95696 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD1O95696 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD1O95696 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD1O95696 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD1O95696 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD1O95696 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD1O95696 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD1O95696 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD1O95696 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD1O95696 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD1O95696 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRD1O95696 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD1O95696 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD1O95696 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD1O95696 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD1O95696 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD1O95696 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD1O95696 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD1O95696 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD1O95696 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD1O95696 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD1O95696 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD1O95696 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD1O95696 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD1O95696 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD1O95696 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD1O95696 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD1O95696 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD1O95696 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD1O95696 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD1O95696 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms