Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM13AO94988 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms