Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBOX1O75936 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.9 ms