Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22BO75396 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC22BO75396 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC22BO75396 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC22BO75396 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC22BO75396 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22BO75396 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22BO75396 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22BO75396 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22BO75396 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms