Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD4O60885 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD4O60885 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD4O60885 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD4O60885 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD4O60885 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD4O60885 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD4O60885 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD4O60885 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD4O60885 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD4O60885 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD4O60885 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD4O60885 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD4O60885 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD4O60885 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD4O60885 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD4O60885 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD4O60885 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD4O60885 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD4O60885 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD4O60885 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD4O60885 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD4O60885 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD4O60885 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD4O60885 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD4O60885 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD4O60885 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD4O60885 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD4O60885 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD4O60885 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD4O60885 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD4O60885 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD4O60885 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD4O60885 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD4O60885 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD4O60885 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD4O60885 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD4O60885 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD4O60885 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD4O60885 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD4O60885 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD4O60885 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD4O60885 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD4O60885 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD4O60885 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD4O60885 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD4O60885 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD4O60885 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD4O60885 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD4O60885 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD4O60885 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD4O60885 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD4O60885 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD4O60885 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD4O60885 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD4O60885 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD4O60885 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD4O60885 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD4O60885 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD4O60885 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD4O60885 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD4O60885 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD4O60885 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD4O60885 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD4O60885 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD4O60885 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD4O60885 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD4O60885 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD4O60885 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD4O60885 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD4O60885 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD4O60885 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRD4O60885 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRD4O60885 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRD4O60885 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRD4O60885 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRD4O60885 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
BRD4O60885 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRD4O60885 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRD4O60885 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRD4O60885 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD4O60885 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRD4O60885 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRD4O60885 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BRD4O60885 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRD4O60885 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRD4O60885 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms