Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms