Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA5O60264 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms