Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRICKLE3O43900 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRICKLE3O43900 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRICKLE3O43900 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRICKLE3O43900 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRICKLE3O43900 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRICKLE3O43900 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRICKLE3O43900 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRICKLE3O43900 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms