Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP9O43818 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP9O43818 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP9O43818 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP9O43818 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP9O43818 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP9O43818 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP9O43818 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP9O43818 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP9O43818 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP9O43818 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP9O43818 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP9O43818 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP9O43818 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP9O43818 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP9O43818 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRP9O43818 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRP9O43818 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRP9O43818 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP9O43818 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP9O43818 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP9O43818 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms