Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms