Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERI3O43414 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERI3O43414 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERI3O43414 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERI3O43414 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERI3O43414 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERI3O43414 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERI3O43414 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERI3O43414 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERI3O43414 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERI3O43414 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERI3O43414 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms