Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms