Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBDO15205 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBDO15205 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBDO15205 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBDO15205 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBDO15205 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBDO15205 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBDO15205 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBDO15205 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBDO15205 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms