Protein–RNA interactions for Protein: O14994

SYN3, Synapsin-3, humanhuman

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3O14994 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN3O14994 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN3O14994 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN3O14994 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN3O14994 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN3O14994 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN3O14994 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN3O14994 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN3O14994 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN3O14994 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN3O14994 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN3O14994 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN3O14994 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN3O14994 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN3O14994 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN3O14994 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN3O14994 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN3O14994 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN3O14994 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYN3O14994 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYN3O14994 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN3O14994 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN3O14994 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN3O14994 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN3O14994 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN3O14994 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN3O14994 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN3O14994 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN3O14994 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN3O14994 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN3O14994 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN3O14994 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYN3O14994 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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