Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN9O14815 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN9O14815 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms