Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms