Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFAO00273 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFAO00273 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFAO00273 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFAO00273 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFAO00273 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFAO00273 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFAO00273 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFAO00273 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFAO00273 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFAO00273 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFAO00273 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DFFAO00273 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DFFAO00273 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DFFAO00273 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DFFAO00273 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DFFAO00273 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DFFAO00273 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DFFAO00273 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DFFAO00273 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DFFAO00273 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DFFAO00273 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DFFAO00273 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DFFAO00273 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms