Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms