Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NPIPB9F8W1W9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB9F8W1W9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms