Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1E9PL57 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms