Protein–RNA interactions for Protein: C9JI98

TMEM238, Transmembrane protein 238, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM238C9JI98 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM238C9JI98 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms